Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
E2F8A0AVK6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms