Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GJA3Q9Y6H8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GJA3Q9Y6H8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GJA3Q9Y6H8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
GJA3Q9Y6H8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GJA3Q9Y6H8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms