Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00312Q9Y6C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00312Q9Y6C7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms