Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H9

PCDHA2, Protocadherin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA2Q9Y5H9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHA2Q9Y5H9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHA2Q9Y5H9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHA2Q9Y5H9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA2Q9Y5H9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA2Q9Y5H9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA2Q9Y5H9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms