Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HDGFL3Q9Y3E1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDGFL3Q9Y3E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms