Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CAB39Q9Y376 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAB39Q9Y376 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAB39Q9Y376 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms