Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP11BQ9Y2G3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP11BQ9Y2G3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP11BQ9Y2G3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP11BQ9Y2G3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP11BQ9Y2G3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms