Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC4Q9Y296 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC4Q9Y296 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms