Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF9BQ9UPX0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGSF9BQ9UPX0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGSF9BQ9UPX0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IGSF9BQ9UPX0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IGSF9BQ9UPX0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms