Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAK1Q9UPV9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAK1Q9UPV9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAK1Q9UPV9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAK1Q9UPV9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAK1Q9UPV9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms