Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP22Q9UPT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP22Q9UPT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP22Q9UPT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP22Q9UPT9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms