Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHF8Q9UPP1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHF8Q9UPP1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
PHF8Q9UPP1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PHF8Q9UPP1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHF8Q9UPP1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms