Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FZD1Q9UP38 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FZD1Q9UP38 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FZD1Q9UP38 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms