Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MKLN1Q9UL63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKLN1Q9UL63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKLN1Q9UL63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKLN1Q9UL63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms