Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CFAP45Q9UL16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFAP45Q9UL16 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFAP45Q9UL16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CFAP45Q9UL16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CFAP45Q9UL16 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CFAP45Q9UL16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms