Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3LQ9UJW3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT3LQ9UJW3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3LQ9UJW3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DNMT3LQ9UJW3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DNMT3LQ9UJW3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms