Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
VAX2Q9UIW0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAX2Q9UIW0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms