Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CTNNA3Q9UI47 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTNNA3Q9UI47 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTNNA3Q9UI47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms