Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPN3Q9UHW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPN3Q9UHW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPN3Q9UHW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms