Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMPXQ9UHP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMPXQ9UHP9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPXQ9UHP9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPXQ9UHP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms