Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUFIP1Q9UHK0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUFIP1Q9UHK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUFIP1Q9UHK0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms