Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHORDC1Q9UHD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHORDC1Q9UHD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHORDC1Q9UHD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHORDC1Q9UHD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms