Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
IFT172Q9UG01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
IFT172Q9UG01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
IFT172Q9UG01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
IFT172Q9UG01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IFT172Q9UG01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms