Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DNMT3BQ9UBC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3BQ9UBC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3BQ9UBC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3BQ9UBC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms