Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSMC3IPQ9P2W1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PSMC3IPQ9P2W1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSMC3IPQ9P2W1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMC3IPQ9P2W1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms