Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A6Q9P2U8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC17A6Q9P2U8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC17A6Q9P2U8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.7 ms