Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRP2BPQ9P2M1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LRP2BPQ9P2M1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LRP2BPQ9P2M1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRP2BPQ9P2M1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LRP2BPQ9P2M1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms