Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL42Q9P2K6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL42Q9P2K6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL42Q9P2K6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms