Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN3Q9P232 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNTN3Q9P232 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN3Q9P232 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN3Q9P232 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN3Q9P232 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms