Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCNT4Q9P109 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GCNT4Q9P109 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCNT4Q9P109 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCNT4Q9P109 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCNT4Q9P109 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms