Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MED11Q9P086 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED11Q9P086 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms