Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
ARHGEF12Q9NZN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARHGEF12Q9NZN5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF12Q9NZN5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms