Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 MCF2L-231ENST00000494043 896 ntTSL 311.87□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 KIAA1522-205ENST00000468130 684 ntTSL 229.69■■■□□ 2.348e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 GNA11-202ENST00000586180 739 ntTSL 326.56■■□□□ 1.848e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-204ENST00000428005 1572 ntTSL 1 (best)23.67■■□□□ 1.388e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 GNA11-206ENST00000590534 2676 ntTSL 219.39■□□□□ 0.78e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.586e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-208ENST00000437266 3407 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.218e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.18e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.058e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.018e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-215ENST00000457377 3600 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 08e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-209ENST00000438530 3825 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -08e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.018e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.028e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.078e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.268e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 VPS9D1-207ENST00000568691 838 ntTSL 313.35□□□□□ -0.278e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.328e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 CHST15-205ENST00000628426 3553 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.518e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 VPS9D1-206ENST00000567379 694 ntTSL 511.28□□□□□ -0.68e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 VPS9D1-205ENST00000565452 178 ntTSL 310.37□□□□□ -0.758e-11■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 PHF23-207ENST00000573826 685 ntTSL 320.83■□□□□ 0.931e-10■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 PHF23-209ENST00000574323 575 ntTSL 415.21■□□□□ 0.031e-10■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 FCGRT-218ENST00000600273 582 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-27■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-27■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 FCGRT-207ENST00000595677 714 ntTSL 516.02■□□□□ 0.161e-27■■■■■ 37.2
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-207ENST00000445582 582 ntTSL 313.35□□□□□ -0.274e-8■■■■■ 37.1
FAM120AQ9NZB2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-9■■■■■ 37.1
FAM120AQ9NZB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.968e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.358e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 216.84■□□□□ 0.298e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 514.08□□□□□ -0.168e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 511.59□□□□□ -0.558e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.838e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.068e-7■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 PTP4A2-204ENST00000475464 366 ntTSL 311.37□□□□□ -0.595e-11■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 PTP4A2-208ENST00000524384 663 ntTSL 59.33□□□□□ -0.925e-11■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 49.32□□□□□ -0.922e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-12■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 49.5□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 37
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 317.07■□□□□ 0.324e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.314e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.664e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.774e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.214e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.334e-66■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 315.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 217.27■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-271ENST00000557353 1919 ntTSL 216.62■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-258ENST00000556716 2718 ntTSL 214.09□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.012e-10■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-12■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.542e-12■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 316.1■□□□□ 0.172e-12■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 514.68□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 36.9
FAM120AQ9NZB2 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.916e-8■■■■■ 36.8
FAM120AQ9NZB2 TMEM245-203ENST00000472207 3261 ntTSL 27.66□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 36.8
FAM120AQ9NZB2 WNT5B-205ENST00000539198 530 ntTSL 423.55■■□□□ 1.366e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 WNT5B-210ENST00000545811 661 ntTSL 221.02■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 36.7
FAM120AQ9NZB2 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 310.06□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 LONP2-204ENST00000564259 819 ntTSL 35.55□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 36.6
FAM120AQ9NZB2 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 27.88□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 36.6
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 285.4 ms