Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RRN3Q9NYV6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RRN3Q9NYV6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RRN3Q9NYV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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