Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP39A1Q9NYL5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP39A1Q9NYL5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP39A1Q9NYL5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP39A1Q9NYL5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms