Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK13-1Q9NX77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVK13-1Q9NX77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVK13-1Q9NX77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVK13-1Q9NX77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms