Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF13Q9NV06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCAF13Q9NV06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCAF13Q9NV06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCAF13Q9NV06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCAF13Q9NV06 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms