Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDREJQ9NTG1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PKDREJQ9NTG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKDREJQ9NTG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms