Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EMILIN3Q9NT22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EMILIN3Q9NT22 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EMILIN3Q9NT22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EMILIN3Q9NT22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EMILIN3Q9NT22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EMILIN3Q9NT22 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EMILIN3Q9NT22 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms