Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA3GQ9NS98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3GQ9NS98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3GQ9NS98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3GQ9NS98 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms