Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHPT1Q9NRX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHPT1Q9NRX4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHPT1Q9NRX4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHPT1Q9NRX4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHPT1Q9NRX4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms