Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6BQ9NRW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6BQ9NRW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6BQ9NRW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB6BQ9NRW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB6BQ9NRW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms