Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMPRSS4Q9NRS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMPRSS4Q9NRS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMPRSS4Q9NRS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms