Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMCO4Q9NRQ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMCO4Q9NRQ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMCO4Q9NRQ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms