Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
FBXO6Q9NRD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FBXO6Q9NRD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO6Q9NRD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO6Q9NRD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms