Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACSS2Q9NR19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSS2Q9NR19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSS2Q9NR19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSS2Q9NR19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms