Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CD163L1Q9NR16 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
CD163L1Q9NR16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CD163L1Q9NR16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CD163L1Q9NR16 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CD163L1Q9NR16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms