Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FSCN3Q9NQT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FSCN3Q9NQT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FSCN3Q9NQT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms