Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MID1IP1Q9NPA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MID1IP1Q9NPA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1IP1Q9NPA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MID1IP1Q9NPA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms