Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC62

SENP2, Sentrin-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP2Q9HC62 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP2Q9HC62 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP2Q9HC62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SENP2Q9HC62 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SENP2Q9HC62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms